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基因数据处理70之Picard安装没成功
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:150
1.下载: https://github.com/broadinstitute/picard.git 2.安装: hadoop@Master:~/xubo/tools/picard$ ant clone-htsjdkBuildfile: /home/hadoop/xubo/tools/picard/build.xmlclone-htsjdk: [exec] Cloning into 'htsjdk'... [echo] Checking out HTSJDK[详细]
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OBIEE RPD开发
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:158
A parent-child hierarchy is a hierarchy of members that all have the same type. This contrasts?with level-based hierarchies,where members of the same type occur only at a single level of the?hierarchy. The most common real-life occurrenc[详细]
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Acdream 1210 Chinese Girls#39; Amusement(大数模板运算 + 找
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:103
传送门 Chinese Girls’ Amusement Time Limit: 2000/1000MS (Java/Others) Memory Limit: 128000/64000KB (Java/Others) Submit Statistic Next Problem Problem Description You must have heard that the Chinese culture is quite different from that[详细]
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10EB量级的基因大数据处理技术
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:132
Java学习网(www.javalearns.com)提拱 10EB量级的基因大数据处理技术 很荣幸在这里跟大家分享大家以前很少接触到的领域的大数据情况。其实生命科学的大数据还处在比较初始的阶段,否则国家也不会现在才开始提出精准医学这样的概念。所谓精准医学想通过大[详细]
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数据分析与挖掘学习(一)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:181
数据分析与挖掘过程 一. 定义挖掘目标 一般的数据挖掘任务包括: 1. 分类与预测 2. 聚类分析 3. 关联规则 4. 时序模式 5. 偏差检验 6. 智能推荐 二. 数据取样 抽取一个与挖掘目标相关的样本子集,标准是 1. 相关性 2. 可靠性 3. 有效性 而不是选用全部数据[详细]
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R在文本挖掘与分析的妙用:分词、画词云
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:123
副标题#e# 报道大数据企业:大数据产品、大数据方案、 ? 大数据人物 分享大数据干货:大数据书籍、大数据报告、 大数据视频 本文转自蔡捕头的新浪博客。欢迎更多优质原创文章投稿给大数据人:289585305@qq.com 摘要:要分析文本内容,最常见的分析方法是提[详细]
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基于K-Means的文本聚类
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:132
http://blog.csdn.net/freesum/article/details/7376006 何为聚类 ? ? ? ? “聚类是把相似的对象通过静态分类的方法分成不同的组别或者更多的子集(subset),这样让在同一个子集中的成员对象都有相似的一些属性。”?? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?[详细]
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Twitter发布新的大数据实时分析系统Heron
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:73
Twitter发布新的大数据实时分析系统Heron http://geek.csdn.net/news/detail/33750 Twitter Heron的深入解析(与Storm的比较) http://www.tuicool.com/articles/2mMZver[详细]
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NMEA-0183之$GPRMC数据处理
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:103
副标题#e# NMEA-0183 u?以下为GPS芯片串口发出的数据: 201512_15:42:3712,$GPTXT,ANTSTATUS=SHORT*43 201512_15:42:37$GNGGA,074219.000,3021.516740,N,12005.998703,E,1,9,1.09,20.996,M,6.991,*42 201512_15:42:37$GNGLL,A,A*45 201512_15:42:37$GPGSA,3[详细]
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【工作帮】微盟数据中心招数据分析师,薪资open
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:85
坐标:上海 微盟:C轮创业公司,投资方包含腾讯、海航等实力资本,拥有toB和toC的电商业务,广告和理财为蓄力点,发展迅速。 微盟数据中心:承接整个集团的数据,体积大,种类多,想象力丰富 微盟数据中心数据分析师:Growth Hacking的推动者,从数据中发[详细]
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使用Zeppelin来实现大数据分析的可视化
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:140
Apache Zeppelin是ASF的一个孵化项目,实现了基于web的在线代码编辑与数据可视化。有点类似Spark-Shell的REPL。其结果可以直接用图表来展示,解决了前端白痴的苦逼。 Zeppelin官网 我们可以直接下载 zeppelin-0.5.6-incubating-bin-all.tgz ,然后部署到服[详细]
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BZOJ 1670 [Usaco2006 Oct]Building the Moat护城河的挖掘
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:199
Description 为了防止口渴的食蚁兽进入他的农场,Farmer John决定在他的农场周围挖一条护城河。农场里一共有N(8=N=5,000)股泉水,并且,护城河总是笔直地连接在河道上的相邻的两股泉水。护城河必须能保护所有的泉水,也就是说,能包围所有的泉水。泉水一定[详细]
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初识聚类算法:K均值、凝聚层次聚类和DBSCAN
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:111
http://blog.sina.com.cn/s/blog_62186b460101ard2.html 聚类分析就仅根据在数据中发现的描述对象及其关系的信息,将数据对象分组(簇)。其目标是,组内的对象相互之间是相似的,而不同组中的对象是不同的。组内相似性越大,组间差别越大,聚类就越好。 先[详细]
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大数据分析界的“神兽”Apache Kylin初解
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:110
副标题#e# 转自李栋,来自Kyligence公司,也是Apache Kylin Committer PMC member,在加入Kyligence之前曾就职于eBay、微软。 今天分享的主题是:聊聊“神兽”Apache Kylin的最新特性。本次分享将首先对Apache Kylin进行基本介绍;接下来介绍1.5.x最新版本[详细]
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kylin-BI工具-tableau9
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:195
副标题#e# Tableau 9 Tableau 9.x has been released a while,there are many users are asking about support this version with Apache Kylin. With updated Kylin ODBC Driver,now user could interactive with Kylin service through Tableau 9.x. Apac[详细]
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数据处理的 9 大编程语言
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:82
副标题#e# (点击上方公众号,可快速关注) 英文:Anna Nicolauo 译者:伯乐在线 - 胡波 链接:http://blog.jobbole.com/100732/ 有关大数据的话题一直很火热。伴随着信息的爆炸式增长,大数据渗透到了各行各业,广泛应用于公司中,同时也使得传统的软件比[详细]
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基因数据处理28之avocado运行
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:194
需要注意的是如果使用avocado的命令行,fs和fq为hdfs路径,properties为本地路径: hadoop@Master:~/xubo/data/testTools/se$ avocado-submit /xubo/avocado/hs1.fq /xubo/avocado/hs38DH.fa /xubo/avocado/test20160527 /home/hadoop/cloud/avocado/basic[详细]
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LightOJ 1370 Bi-shoe and Phi-shoe(欧拉函数)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:67
题目链接: LightOJ 1370 Bi-shoe and Phi-shoe 题意: 给出n个数,要求对每个数a[i]找一个数x[i]使得小于x[i]且与x[i]互素的数的个数不小于a[i],求出所有x[i]的最小和。 分析: 和最小则每个数对应的x[i]应最[详细]
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基因数据处理26之bcftools安装和使用
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-07 热度:108
1.下载: https://github.com/samtools/bcftools 2.安装 make make install 3.结合samtools使用 对排序好的bam数据用samtools生成bcf文件: xubo@xubo:~/xubo/data/testTools/se$ samtools mpileup -ugf ../hs38DH.fa hs2.sort.bam hs2.bcf 由于生成的是二[详细]
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WindowsXP SP3 AFD.sys 本地拒绝服务漏洞的挖掘过程
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:193
标 题: WindowsXP SP3 AFD.sys 本地拒绝服务漏洞的挖掘过程 时 间: 2013-03-17,15:22:33 这是本人第一次做漏洞挖掘,2月的时候开始研究漏洞挖掘技术,2月24号那天在进行Fuzz测试的时候偶然的发现了一个afd.sys未处理的异常,然后就对这个异常如获至宝的分[详细]
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520我与大数据有个约会——上海大数据创新应用论坛完美落幕
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:142
副标题#e# 2016年5月20日周五下午,由上海市大数据联盟牵头,慧与(中国)有限公司、联通小沃科技与华院数据共同承办,来自金融服务业、运营商、零售及电商、制造等行业的大数据应用先行者们为各行各业170余位来宾们打开了一扇通向大数据应用落地彼岸的智慧之[详细]
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基因数据处理31之avocado运行avocado-cli中的avocado问题3-变异
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:140
读入的read为: val fqFile = "hs38DHSE1L100F1.sam" 读取结果: cleanedReads.count:1{"readNum": 0,"contig": {"contigName": "chrUn_KN707963v1_decoy","contigLength": 62955,"contigMD5": null,"referenceURL": null,"assembly": null,"species": nul[详细]
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基因数据处理32之Avocado运行记录(人造数据集)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:70
副标题#e# 主要是需要数据正确,如果中间缺少记录,avocado一般不会成功 1.代码: Avocado修改: /** * Licensed to Big Data Genomics (BDG) under one * or more contributor license agreements. See the NOTICE file * distributed with this work for[详细]
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基因数据处理30之avocado运行avocado-cli中的avocado问题1和2
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:195
问题1: avocado中的run方法中: println("stats.coverage:" + stats.coverage) 调用的是: lazy val coverage = ComputingCoverage.time { ScoreCoverage(inputDataset) } 然后报错: Exception in thread "main" java.lang.UnsupportedOperationExceptio[详细]
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基因数据处理33之Avocado运行记录(参考基因组)
所属栏目:[大数据] 日期:2021-03-06 热度:59
1.数据下载: avocaodo的test resource中 2.预处理: cat Homo_sapiens_assembly19.fasta | grep -i -n '' Homo_sapiens_assembly19Head.txt cat Homo_sapiens_assembly19Head.txt cat Homo_sapiens_assembly19.fasta | head -34770016 |tail -787820 Homo[详细]